دانشکده مهندسی کامپیوتر در سال ۱۳۹۲ با جدا شدن از دانشکده مهندسی برق به عنوان یک دانشكده مستقل در پرديس سيدخندان دانشگاه صنعتي خواجه نصيرالدين طوسي تاسيس شد. اين دانشكده فعاليت خود را از سال ۱۳۸۴ به عنوان يكي از گروههاي آموزشي در دانشكده مهندسي برق آغاز نمود.